Hola Madness,
No hay ni debería haber ninguna diferencia entre la germinación de una variedad autofloreciente y cualquier otra, más allá de las peculiaridades de cada genética.
Por ejemplo, puedes ver los seguimientos de Roadrunner que se han hecho en el foro de nuestra web para hacerte a la idea:
http://dinafem-seeds.com/foros/topic/seguimiento-roadrunner
No se a que se pueden deber las rarezas que nos comentas, tal vez puede ser debido al frío u otros factores.
De todos modos, comentanos como evolucionan y veremos en que se te puede ayudar...
saludos